B Комиссию входят по девять немецких и российских экспертов-ученых, а также по три ведущих представителя ключевых архивов. Члены Комиссии утверждаются на пять лет; при этом в отношении девяти членов Комиссии из числа ученых с каждой из сторон допускается одно повторное назначение. Каждая сторона выбирает по одному Сопредседателю из ряда своих членов.

Настоящий состав Комиссии (четвертый срок полномочий, 2015-2020)
 

Российская сторона:

• Сопредседатель: академик, д.и.н., проф.  Александр Чубарьян

Действительный член Российской Академии наук, научный руководитель Института всеобщей истории РАН

• Надежда Баринова
Директор Историко-документального департамента Министерства иностранных дел РФ

• д.и.н., проф.  Александ Борозняк (1933-21.12.2015)

Липецкий государственный педагогический университет

• д.и.н., проф.  Александр Ватлин

Московский государственный университет им. М.В. Ломоносов

• д.и.н., проф. Нина Вашкау

Липецкий государственный педагогический университет

• д.и.н., проф.  Александр Галкин (почетный член комиссии)

Институт социологии РАН

•  д.и.н., проф.  Яков Драбкин (почетный член комиссии, скончался 10.10.2015)

Государственный академический университет гуманитарных наук

•  д.и.н, проф. Сергей Мироненко

Научный руководитель Государственного архива Российской Федерации

•  д.и.н., проф. Николай Павлов

 МГИМО-Университет МИД РФ

•  д.и.н. Юрий Петров

Директор Института российской историии РАН

•  д.и.н., проф. РАН Алексей Синдеев,

Гл.н.с. Института Европы РАН

•  к.и.н. Сергей Случ

Институт славяноведения РАН

•  к.и.н. Наталья Тимофеева

Воронежский институт высоких технологий

•  д.и.н., проф.  Алексей Филитов

Институт всеобщей истории РАН

•  д.ю.н., проф. Василий Христофоров
Руководитель Центра публикации источников по истории России XX века, Институт Российской истории РАН

•  к.и.и. Андрей Юрасов
Заместитель руководителя Федерального архивного агентства РФ

Германская сторона

• Сопредседатель: д-р, проф. Анреас Виршинг
С 2011 г. директор Института современной истории Мюнхен/Берлин

•  д-р, проф. Йорг Баберовски
Берлинский университет имени Гумбольдта

•  д-р, проф. Эльке фрайфрау фон Бёзелагер

Руководитель политического архива Федерального министерства иностранных дел

•  д-р Сандра Дальке
С 2018 г. Директор Германского исторического института в Москве

• д-р Йорг Морре
Директор Германо-Российского музея Берлин-Карлсхорст

 •  д-р, проф. Зенке Найтцель
Университет г. Потсдам

 •  д-р, проф. Таня Пентер
Университет г. Хайдельберг

• д-р, проф. Мари-Луизе Реккер
Университет г. Франкфурт на Майне

• д-р, проф. Беате Физелер

Университет г. Дюссельдорф

•  д-р Михаэль Холманн
Президент Федерального архива

•   Роланд Ян
Федеральный уполномоченный по документам службы государственной безопасности бывшей ГДР